美少女圣记：21世纪初，世界遭受了一场神秘生命体的袭击，遭受了毁灭性的破坏。主人公安能圭居住的小镇已被隔离，并受到自卫队的持续巡逻。圭和儿时好友松户直树一起申请加入据称是政府批准的组织“神灵”。在那里，他邂逅了名为阿玛拉的神秘少女，并深深地被她吸引。与此同时，圭成为了名为“神女仆”的神秘机器人的驾驶员。如今，作为终极武器的神女仆与自卫队无法匹敌的神秘生命体展开战斗，危及人类的生存！AIC出品的全新科幻动画，以《天地无用》和《埃尔哈扎德》等众多作品而闻名！在一个人类因神秘生命体的袭击而濒临灭绝的世界里，Kei申请加入据称受政府批准的组织“精灵”。在那里，他邂逅了一位名叫Amara的神秘少女，并被她深深吸引。与此同时，Kei和他的朋友们成为了“Devadasii”的驾驶员，而“Devadasii”是唯一能够对抗神秘生命体的生物……